Protein–RNA interactions for Protein: P28360

MSX1, Homeobox protein MSX-1, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSX1P28360 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSX1P28360 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSX1P28360 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSX1P28360 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSX1P28360 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSX1P28360 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSX1P28360 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MSX1P28360 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSX1P28360 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSX1P28360 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSX1P28360 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSX1P28360 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSX1P28360 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSX1P28360 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSX1P28360 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSX1P28360 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSX1P28360 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSX1P28360 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSX1P28360 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSX1P28360 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSX1P28360 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSX1P28360 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MSX1P28360 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MSX1P28360 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MSX1P28360 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSX1P28360 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSX1P28360 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MSX1P28360 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSX1P28360 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSX1P28360 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSX1P28360 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSX1P28360 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSX1P28360 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSX1P28360 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MSX1P28360 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSX1P28360 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MSX1P28360 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MSX1P28360 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSX1P28360 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSX1P28360 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSX1P28360 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSX1P28360 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSX1P28360 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSX1P28360 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSX1P28360 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSX1P28360 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSX1P28360 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSX1P28360 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSX1P28360 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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