Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD10P28358 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD10P28358 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms