Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms