Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD58P19256 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD58P19256 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD58P19256 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD58P19256 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD58P19256 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD58P19256 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD58P19256 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD58P19256 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD58P19256 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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