Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF4P18085 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF4P18085 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF4P18085 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF4P18085 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF4P18085 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF4P18085 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF4P18085 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF4P18085 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF4P18085 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF4P18085 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF4P18085 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF4P18085 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF4P18085 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF4P18085 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF4P18085 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARF4P18085 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARF4P18085 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF4P18085 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF4P18085 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF4P18085 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF4P18085 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF4P18085 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF4P18085 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF4P18085 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF4P18085 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF4P18085 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF4P18085 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF4P18085 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF4P18085 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF4P18085 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF4P18085 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF4P18085 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF4P18085 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF4P18085 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF4P18085 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF4P18085 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF4P18085 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF4P18085 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF4P18085 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF4P18085 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF4P18085 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF4P18085 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF4P18085 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF4P18085 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF4P18085 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF4P18085 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF4P18085 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF4P18085 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms