Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAV1P15498 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAV1P15498 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAV1P15498 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAV1P15498 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAV1P15498 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAV1P15498 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAV1P15498 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAV1P15498 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAV1P15498 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAV1P15498 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAV1P15498 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAV1P15498 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAV1P15498 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAV1P15498 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms