Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms