Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TOP2AP11388 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms