Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms