Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GLI3P10071 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GLI3P10071 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GLI3P10071 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GLI3P10071 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GLI3P10071 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GLI3P10071 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GLI3P10071 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GLI3P10071 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GLI3P10071 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GLI3P10071 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GLI3P10071 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GLI3P10071 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GLI3P10071 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GLI3P10071 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GLI3P10071 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GLI3P10071 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GLI3P10071 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GLI3P10071 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GLI3P10071 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GLI3P10071 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GLI3P10071 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GLI3P10071 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GLI3P10071 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI3P10071 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms