Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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