Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms