Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-2B6SEH9 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms