Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF839A8K0R7 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms