Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms