Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJB4Q9UDY4 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms