Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD5

ORC3, Origin recognition complex subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ORC3Q9UBD5 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ORC3Q9UBD5 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms