Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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