Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHST12Q9NRB3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms