Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX1

PRDM5, PR domain zinc finger protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM5Q9NQX1 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRDM5Q9NQX1 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRDM5Q9NQX1 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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