Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms