Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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TMEM27Q9HBJ8 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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