Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 RNGTT-203ENST00000538899 1374 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 TTC8-206ENST00000380656 2171 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 TIPIN-201ENST00000261881 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 ACR-201ENST00000216139 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 UBE2A-211ENST00000631185 1435 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 ANKS1B-201ENST00000329257 996 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 PSMD10-204ENST00000361815 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM96A-202ENST00000380290 826 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01291-202ENST00000418204 441 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 ALMS1P1-201ENST00000428767 921 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 BUB3P1-201ENST00000458451 999 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 HSD17B7P2-201ENST00000471365 1033 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC091152.1-201ENST00000472109 838 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC027328.1-201ENST00000505784 335 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 NDUFA2-204ENST00000512088 627 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 RTN4IP1-204ENST00000539449 814 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AF111167.1-201ENST00000555909 704 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 PSMA4-219ENST00000560217 944 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC011444.2-201ENST00000587759 567 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 RBM22P4-201ENST00000613117 1240 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AL158850.2-204ENST00000616537 1188 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC068631.1-207ENST00000630315 821 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 TMEM97-202ENST00000336687 2115 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC209007.1-201ENST00000401075 1342 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 GABRB2-204ENST00000517547 1349 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 PRKAG1-201ENST00000316299 1683 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms