Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLVAPQ9BX97 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms