Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms