Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRIQ1Q96JM4 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms