Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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SGF29Q96ES7 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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SGF29Q96ES7 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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SGF29Q96ES7 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGF29Q96ES7 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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SGF29Q96ES7 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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SGF29Q96ES7 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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SGF29Q96ES7 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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SGF29Q96ES7 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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SGF29Q96ES7 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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