Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms