Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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UBXN4Q92575 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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UBXN4Q92575 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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UBXN4Q92575 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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UBXN4Q92575 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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UBXN4Q92575 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBXN4Q92575 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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