Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC12Q8WUD4 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms