Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP1Q8TDR0 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms