Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC112Q8NEF3 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms