Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms