Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 LITAF-203ENST00000413364 2292 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 VIPAS39-206ENST00000553888 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 Z97192.3-201ENST00000420902 2975 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 RSPH10B2-201ENST00000297186 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 RSPH10B-201ENST00000337579 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms