Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLX4IPQ5VYV7 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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