Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms