Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ALFQ53S48 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms