Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms