Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms