Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NTRK2Q16620 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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