Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABRA6Q16445 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms