Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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E2F4Q16254 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 AC243964.3-201ENST00000623022 2028 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F4Q16254 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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