Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKIV2LQ15477 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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