Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SIX1Q15475 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SIX1Q15475 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SIX1Q15475 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SIX1Q15475 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SIX1Q15475 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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