Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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