Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPRKQ15262 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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PTPRKQ15262 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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PTPRKQ15262 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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PTPRKQ15262 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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PTPRKQ15262 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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PTPRKQ15262 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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PTPRKQ15262 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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