Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HERC3Q15034 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HERC3Q15034 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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