Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP1Q13835 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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