Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE3BQ13370 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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