Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 CBWD3-206ENST00000478048 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 APOC2-201ENST00000252490 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AL133216.1-201ENST00000428915 727 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC026774.2-201ENST00000513990 1098 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 C14orf159-208ENST00000517877 591 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AMN1-212ENST00000542781 879 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC073857.1-201ENST00000625082 1054 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms